La Terre est plongée dans le désespoir depuis sa défaite face aux Illumidas... Les survivants n'ont d'autre choix que de regagner leur foyer avec l'armée ennemie qui occupe désormais la planète... Harlock (Albator), courageux militaire dont la dernière mission était de transporter les réfugiés, reçoit l'ordre de hisser le drapeau de la capitulation et d'atterrir sur Terre. Mais la voix de la résistance, portée par la douce Maya, s'élève : il faut dépasser la défaite d'aujourd'hui et continuer à vivre en croyant à demain...